Résultat

L’infection à Helicobacter pylori (H. pylori) est la principale cause de l’ulcère gastrique et constitue un facteur de risque majeur de cancer gastrique —le seul cancer pouvant être prévenu par des antimicrobiens ciblés contre l’infection à H. pylori. H. pylori est présente chez environ 13 millions de Canadiens. Cette maladie clinique se manifeste chez 10 % d’entre eux. Les infections à H. pylori et les cancers gastriques qu’elle provoque touchent de manière disproportionnée les populations autochtones. Malgré une normalisation relative, le traitement est complexe (trithérapie ou quadrithérapie) et l’épreuve de sensibilité aux antimicrobiens (ESA) de la bactérie H. pylori est difficile à réaliser. Il est donc urgent de trouver une solution de rechange efficace pour diagnostiquer les infections à H. pylori et déterminer la résistance aux antimicrobiens (RAM). Ce projet permettra d’établir un prototype de pipeline de bout en bout d’analyse métagénomique pour la détermination, la détection de la RAM ainsi que le profilage de la virulence de la bactérie H. pylori directement à partir de spécimens cliniques. Il créera également une base de données de référence sur la RAM de H. pylori. L’équipe élaborera des rapports nationaux sur l’ESA (sous la forme d’un antibiogramme) à partir de ces données. Parmi les avantages potentiels, citons la possibilité d’avoir des tests plus rapides et plus précis, un meilleur traitement grâce aux données des antibiogrammes individuels et locaux, ainsi qu’une réduction du risque de cancer gastrique après un diagnostic et un traitement réussi. Les données du projet alimenteront un système national de surveillance de la bactérie H. pylori, permettant aux communautés cliniques, de santé publique et scientifiques de mieux comprendre sa diversité au Canada. L’objectif final constituera à réduire le poids social et économique des infections à H. pylori qui pèse sur les Canadiens.