{"id":1072,"date":"2021-10-01T19:20:44","date_gmt":"2021-10-01T19:20:44","guid":{"rendered":"https:\/\/genomecanada.ca\/drupal\/blog\/hostseq-permettre-lechange-de-donnees-pour-lutter-contre-la-covid-19-et-resoudre\/"},"modified":"2022-05-02T13:45:14","modified_gmt":"2022-05-02T13:45:14","slug":"hostseq-permettre-lechange-de-donnees-pour-lutter-contre-la-covid-19-et-resoudre","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/genomecanada.ca\/fr\/hostseq-permettre-lechange-de-donnees-pour-lutter-contre-la-covid-19-et-resoudre\/","title":{"rendered":"HostSeq : Permettre l\u2019\u00e9change de donn\u00e9es pour lutter contre la COVID-19 et r\u00e9soudre des probl\u00e8mes de sant\u00e9 futurs"},"content":{"rendered":"

Entrevue avec Ma\u2019n H. Zawati, Ph. D.<\/strong>, professeur adjoint, Facult\u00e9 de m\u00e9decine et des sciences de la sant\u00e9 de l\u2019Universit\u00e9 McGill; directeur ex\u00e9cutif, Centre de g\u00e9nomique et politiques du D\u00e9partement de g\u00e9n\u00e9tique humaine; responsable, Bureau de la conformit\u00e9 de l\u2019acc\u00e8s aux donn\u00e9es HostSeq.<\/h2>\n

\"Ma\u2019n<\/p>\n

La banque de donn\u00e9es du projet HostSeq de CGEn<\/strong> constitue une nouvelle infrastructure d\u2019importance vitale pour la collaboration en recherche dans la lutte contre la COVID-19 et la r\u00e9solution d\u2019autres grands probl\u00e8mes de sant\u00e9 auxquels font face les collectivit\u00e9s canadiennes. Cette banque de donn\u00e9es, aliment\u00e9e par les donn\u00e9es g\u00e9nomiques produites par le s\u00e9quen\u00e7age de quelque 10\u2009000 g\u00e9nomes humains dans le cadre du projet HostSeq du R\u00e9seau canadien de g\u00e9nomique COVID-19 (RCanG\u00e9CO), est la premi\u00e8re du genre<\/a> au Canada.<\/p>\n

Les chercheurs qualifi\u00e9s peuvent demander l\u2019acc\u00e8s \u00e0 la banque de donn\u00e9es par l\u2019entremise du Bureau de la conformit\u00e9 de l\u2019acc\u00e8s aux donn\u00e9es<\/strong><\/a> (BCAD)<\/strong>, qui supervise le processus global de demandes de donn\u00e9es, qui comprend en outre une \u00e9valuation <\/a>par un comit\u00e9 ind\u00e9pendant d\u2019acc\u00e8s aux donn\u00e9es (CAD). Les demandes d\u2019acc\u00e8s sont \u00e9valu\u00e9es en fonction d\u2019une s\u00e9rie de crit\u00e8res qui comprend, sans s\u2019y limiter, la compatibilit\u00e9 de la proposition avec les objectifs du projet HostSeq et la faisabilit\u00e9 du projet propos\u00e9.<\/p>\n

\"DEMANDE<\/p>\n

Les travaux du projet HostSeq, dont une s\u00e9rie de projets fond\u00e9s sur des cohortes, visent \u00e0 mieux caract\u00e9riser le r\u00f4le de la g\u00e9n\u00e9tique humaine dans la COVID-19, \u00e0 trouver de nouveaux biomarqueurs pr\u00e9dictifs des personnes les plus \u00e0 risque et \u00e0 mettre en \u0153uvre des strat\u00e9gies pertinentes en mati\u00e8re de soins de sant\u00e9, notamment d\u2019\u00e9ventuels soins de sant\u00e9 de pr\u00e9cision.<\/p>\n

Nous avons demand\u00e9 \u00e0 <\/strong>M. Ma\u2019n Zawati<\/strong><\/a>, Ph. D., responsable du Bureau de la conformit\u00e9 de l\u2019acc\u00e8s aux donn\u00e9es du projet HostSeq de nous expliquer plus en d\u00e9tail l\u2019acc\u00e8s aux donn\u00e9es, par l\u2019entremise du projet HostSeq, et sa contribution \u00e0 la lutte contre la COVID-19 au Canada.<\/strong> La recherche de M. Zawati porte principalement sur les aspects juridiques, \u00e9thiques et strat\u00e9giques de la recherche en g\u00e9nomique et en sant\u00e9, en particulier les biobanques, l\u2019\u00e9change de donn\u00e9es, la responsabilit\u00e9 professionnelle et l\u2019utilisation des nouvelles technologies dans les milieux cliniques et de recherche. <\/p>\n

Lisez notre entrevue avec M. Zawati, Ph. D., ci-dessous. <\/strong><\/h2>\n
\n

\u00ab L\u2019id\u00e9e n\u2019est pas seulement de permettre l\u2019\u00e9change de donn\u00e9es sur la COVID-19, mais aussi de donn\u00e9es sur d\u2019autres r\u00e9sultats de sant\u00e9 et d\u2019\u00e9tablir des plans strat\u00e9giques en pr\u00e9vision de probl\u00e8mes futurs en sant\u00e9 publique. \u00bb \u2014 Ma\u2019n H. Zawati, Ph. D.<\/em><\/h3>\n
\n

Qu\u2019est-ce qui vous enthousiasme le plus dans votre travail avec le RCanG\u00e9CO?<\/strong><\/h2>\n

Nous vivons tous encore une p\u00e9riode tr\u00e8s difficile et les histoires d\u00e9chirantes demeurent tr\u00e8s nombreuses. En m\u00eame temps, la pand\u00e9mie a incit\u00e9 un grand nombre d\u2019entre nous \u00e0 tisser de nouveaux liens : en tant que pays, en tant qu\u2019organisations et en tant que chercheurs. C\u2019est un privil\u00e8ge de pouvoir collaborer avec un groupe interdisciplinaire d\u2019experts \u00e0 la lutte contre la COVID-19 et de contribuer \u00e0 la compr\u00e9hension du virus qui cause cette maladie et de ses r\u00e9percussions. Le travail strat\u00e9gique que nous faisons au Centre de g\u00e9nomique et politiques, par l\u2019entremise du projet HostSeq, vise \u00e0 faciliter cette compr\u00e9hension et \u00e0 fournir aux chercheurs des outils utiles pour jeter les bases d\u2019une r\u00e9ponse plus solide au prochain grand d\u00e9fi en sant\u00e9 publique.<\/p>\n

Comment la banque de donn\u00e9es du projet HostSeq de CGen est-elle structur\u00e9e?<\/strong><\/h2>\n

La banque de donn\u00e9es est divis\u00e9e en deux ensembles de donn\u00e9es. Le premier contient des donn\u00e9es d\u2019acc\u00e8s libre qui comprennent de l\u2019information g\u00e9nomique agr\u00e9g\u00e9e, ainsi que des renseignements personnels sur la sant\u00e9 agr\u00e9g\u00e9s \u00e9galement (p. ex. les groupes d\u2019\u00e2ge, l\u2019ascendance, les probl\u00e8mes pr\u00e9existants et le tabagisme, pour n\u2019en nommer que quelques-uns). Le deuxi\u00e8me ensemble de donn\u00e9es contient des donn\u00e9es d\u2019acc\u00e8s contr\u00f4l\u00e9, dont des renseignements g\u00e9nomiques individuels, par exemple les donn\u00e9es de s\u00e9quen\u00e7age pang\u00e9nomique, de m\u00eame que les renseignements personnels et sanitaires d\u2019individus (p. ex., des renseignements cliniques sur les sympt\u00f4mes de la maladie chez une personne).<\/p>\n

\u00c0 quelles questions pourrait-on r\u00e9pondre gr\u00e2ce aux donn\u00e9es du projet HostSeq?<\/strong><\/h2>\n

Les donn\u00e9es produites par le projet HostSeq nous aident \u00e0 d\u00e9terminer les facteurs de risque g\u00e9n\u00e9tiques d\u2019infection virale. Elles nous aident \u00e9galement \u00e0 orienter la r\u00e9ponse de la sant\u00e9 publique \u00e0 la COVID-19, de m\u00eame que notre r\u00e9ponse aux pand\u00e9mies futures et aux autres probl\u00e8mes de sant\u00e9 publique. Par exemple, des chercheurs utilisent les donn\u00e9es pour d\u00e9terminer des cibles possibles de th\u00e9rapies et cr\u00e9er des vaccins cibl\u00e9s ou d\u2019autres traitements. Ces donn\u00e9es seront tr\u00e8s utiles \u00e0 la communaut\u00e9 des chercheurs.<\/p>\n

Quel r\u00f4le le Bureau de la conformit\u00e9 de l\u2019acc\u00e8s aux donn\u00e9es (BCAD) du projet HostSeq joue-t-il dans l\u2019examen des demandes de donn\u00e9es? <\/strong><\/h2>\n

Le BCAD facilite et simplifie le processus d\u2019acc\u00e8s aux donn\u00e9es contr\u00f4l\u00e9es disponibles en veillant \u00e0 ce que les demandes d\u2019acc\u00e8s aux donn\u00e9es soient \u00e9valu\u00e9es de mani\u00e8re efficace et \u00e9quitable. Nous veillons \u00e0 l\u2019\u00e9valuation administrative rapide de chaque demande, avant qu\u2019elle ne soit envoy\u00e9e \u00e0 un comit\u00e9 ind\u00e9pendant d\u2019acc\u00e8s aux donn\u00e9es pour \u00e9valuation d\u00e9finitive. Ce comit\u00e9 se compose d\u2019experts canadiens qui connaissent les diff\u00e9rents domaines de travail li\u00e9s \u00e0 la COVID-19, qu\u2019il s\u2019agisse des maladies infectieuses, de la TI, de la g\u00e9nomique ou des questions \u00e9thiques, pour examiner chaque demande. Le comit\u00e9 comprend \u00e9galement un repr\u00e9sentant des patients.<\/p>\n

Qui peut acc\u00e9der aux donn\u00e9es recueillies par le projet HostSeq? Quels titres et qualit\u00e9s faut-il avoir pour avoir acc\u00e8s aux donn\u00e9es? <\/strong><\/h2>\n

Les donn\u00e9es sur les h\u00f4tes sont \u00e0 la disposition des chercheurs canadiens et internationaux issus de diff\u00e9rentes disciplines, qu\u2019ils travaillent dans des universit\u00e9s, une entreprise priv\u00e9e ou des h\u00f4pitaux. Notre analyse de chaque demande de donn\u00e9es est fond\u00e9e sur la question de recherche \u00e0 laquelle une \u00e9quipe cherche \u00e0 r\u00e9pondre. Nous examinons les titres et les qualit\u00e9s des membres de l\u2019\u00e9quipe de recherche, le bien-fond\u00e9 scientifique et la faisabilit\u00e9 du projet. Les chercheurs ont g\u00e9n\u00e9ralement obtenu l\u2019approbation d\u2019un comit\u00e9 d\u2019\u00e9thique de la recherche ou fournissent une renonciation avant de s\u2019adresser \u00e0 nous. Une fois que le Comit\u00e9 d\u2019acc\u00e8s aux donn\u00e9es a approuv\u00e9 la demande, une entente est sign\u00e9e et l\u2019acc\u00e8s est accord\u00e9 pour un an. Le projet HostSeq est \u00e9tabli en fonction de la contribution et de l\u2019accessibilit\u00e9 des chercheurs canadiens, mais aussi dans le but d\u2019une participation internationale.<\/p>\n

Comment prot\u00e8ge-t-on la vie priv\u00e9e des patients?<\/strong><\/h2>\n

Le projet HostSeq a adopt\u00e9 des mesures strictes de protection des donn\u00e9es et de la vie priv\u00e9e que nous prenons tr\u00e8s au s\u00e9rieux. La base de donn\u00e9es ne recueille ni ne stocke aucun renseignement qui permet d\u2019identifier directement des participants. Comme je l\u2019ai dit pr\u00e9c\u00e9demment, lorsque des donn\u00e9es contr\u00f4l\u00e9es sont fournies aux chercheurs, ces derniers doivent \u00e9galement signer une entente qui les lie, eux-m\u00eames et leur(s) \u00e9tablissement(s) \u00e0 des conditions tr\u00e8s claires. Par exemple, des chercheurs ne peuvent pas partager des donn\u00e9es du projet HostSeq avec des parties non autoris\u00e9es. Pour nous, c\u2019est une question de r\u00e9ciprocit\u00e9. Lorsque des participants partagent leurs donn\u00e9es avec nous, ils s\u2019attendent, entre autres, \u00e0 ce que nous prot\u00e9gions la confidentialit\u00e9 de leurs donn\u00e9es et respections leurs contributions. En agissant de cette mani\u00e8re, nous maintenons la confiance qui est \u00e0 la base de tous ces travaux.<\/p>\n

\n

Le R\u00e9seau canadien de g\u00e9nomique COVID-19 (RCanG\u00e9CO)<\/a> a pour mission de relever le d\u00e9fi de la COVID-19 en produisant les donn\u00e9es accessibles et utilisables des g\u00e9nomes viraux et humains pour orienter les d\u00e9cisions strat\u00e9giques et les d\u00e9cisions en sant\u00e9 publique, et mettre au point des traitements et des vaccins. Ce consortium pancanadien est dirig\u00e9 par G\u00e9nome Canada, en partenariat avec les six centres de g\u00e9nomique r\u00e9gionaux, le Laboratoire national de microbiologie et les laboratoires provinciaux de sant\u00e9 publique, les centres de s\u00e9quen\u00e7age du g\u00e9nome (par le truchement de CGEn), les h\u00f4pitaux, les universit\u00e9s et l\u2019industrie dans l\u2019ensemble du pays.<\/em><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Entrevue avec Ma\u2019n H. Zawati, Ph. D., professeur adjoint, Facult\u00e9 de m\u00e9decine et des sciences de la sant\u00e9 de l\u2019Universit\u00e9 McGill; directeur ex\u00e9cutif, Centre de g\u00e9nomique et politiques du D\u00e9partement de g\u00e9n\u00e9tique humaine; responsable, Bureau de la conformit\u00e9 de l\u2019acc\u00e8s aux donn\u00e9es HostSeq. 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