{"id":12271,"date":"2021-04-27T13:27:00","date_gmt":"2021-04-27T13:27:00","guid":{"rendered":"https:\/\/genomecanada.ca\/drupal\/news_release\/genome-canada-lance-le-portail-national-de-donnees-pour-suivre-la-covid-19-en-temps-reel\/"},"modified":"2022-05-05T15:59:58","modified_gmt":"2022-05-05T19:59:58","slug":"genome-canada-lance-le-portail-national-de-donnees-pour-suivre-la-covid-19-en-temps-reel","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/genomecanada.ca\/fr\/genome-canada-lance-le-portail-national-de-donnees-pour-suivre-la-covid-19-en-temps-reel\/","title":{"rendered":"G\u00e9nome Canada lance le portail national de donn\u00e9es pour suivre la COVID-19 en temps r\u00e9el"},"content":{"rendered":"

G\u00e9nome Canada a lanc\u00e9 aujourd\u2019hui le Portail canadien de donn\u00e9es du projet VirusSeq<\/strong><\/a> afin de suivre l\u2019\u00e9volution de la pand\u00e9mie de COVID-19 au Canada. Maintenant en ligne, le portail est un pilier tr\u00e8s attendu de l\u2019infrastructure nationale de donn\u00e9es qui renforcera la capacit\u00e9 du Canada de g\u00e9rer la pand\u00e9mie actuelle \u2014 et toute pand\u00e9mie ult\u00e9rieure \u2014 par l\u2019\u00e9change et le ressourcement des s\u00e9quences des g\u00e9nomes viraux. Cette solution canadienne en mati\u00e8re de donn\u00e9es est l\u2019un des principaux livrables de la Strat\u00e9gie int\u00e9gr\u00e9e de lutte contre les variants pr\u00e9occupants<\/strong><\/a> de 53\u00a0millions de dollars, annonc\u00e9e par le gouvernement du Canada le 12\u00a0f\u00e9vrier\u00a02021, pour d\u00e9tecter et contrer les variants pr\u00e9occupants de la COVID-19 au Canada.<\/p>\n

Ajout indispensable aux efforts du R\u00e9seau canadien de g\u00e9nomique COVID-19<\/strong><\/a> (RCanG\u00e9CO), le nouveau portail national permet l\u2019\u00e9change en temps r\u00e9el des donn\u00e9es et regroupe les s\u00e9quences des g\u00e9nomes du SRAS-CoV-2 utilis\u00e9es pour d\u00e9tecter et diagnostiquer les nouveaux variants et en pr\u00e9voir la propagation, de m\u00eame que les m\u00e9tadonn\u00e9es connexes du Laboratoire national de microbiologie (LNM) de l\u2019Agence de sant\u00e9 publique du Canada et des laboratoires de sant\u00e9 publique du pays. Ce portail donne aux chercheurs canadiens et aux experts de la sant\u00e9 publique une seule plateforme \u00e0 partir de laquelle t\u00e9l\u00e9verser des donn\u00e9es g\u00e9nomiques exhaustives et normalis\u00e9es sur les virus et permettre aux experts d\u2019interagir et de collaborer avec les auteurs des donn\u00e9es. G\u00e9nome Canada sera le consignataire des donn\u00e9es.<\/p>\n

Le portail fournira aux chercheurs, aux dirigeants de la sant\u00e9 publique et \u00e0 d\u2019autres experts qui participent \u00e0 l\u2019\u00e9laboration de la r\u00e9ponse canadienne \u00e0 la pand\u00e9mie un tableau clair du virus partout au pays, y compris la d\u00e9tection, la transmission, l\u2019\u00e9volution et le tra\u00e7age des variants pr\u00e9occupants. Il r\u00e9sulte de mois de travaux pr\u00e9paratoires men\u00e9s par le professeur en g\u00e9n\u00e9tique humaine, Guillaume Bourque, Ph.\u00a0D., et son \u00e9quipe de recherche de l\u2019Universit\u00e9 McGill, en collaboration avec les chercheurs du projet VirusSeq du RCanG\u00e9CO<\/strong><\/a> et d\u2019autres chercheurs en g\u00e9nomique renomm\u00e9s qui se sp\u00e9cialisent dans la science et la politique en mati\u00e8re de donn\u00e9es, dont Fiona Brinkman, Ph.\u00a0D. (Simon Fraser University), William Hsiao, Ph.\u00a0D. (Simon Fraser University), Lincoln Stein, Ph.\u00a0D. (Institut ontarien de recherche sur le cancer) et Yann Joly, Ph.\u00a0D. (Universit\u00e9 McGill).<\/p>\n

L\u2019\u00e9quipe de M.\u00a0Bourque travaillera avec DNAstack<\/strong><\/a> afin d\u2019int\u00e9grer le Nuage COVID, une plateforme infonuagique qui aide les chercheurs et les d\u00e9cideurs \u00e0 mieux conna\u00eetre la COVID-19 \u00e0 l\u2019aide de la g\u00e9nomique et d\u2019autres ensembles de donn\u00e9es. Le Nuage COVID sert \u00e0 l\u2019\u00e9change des donn\u00e9es selon des normes ouvertes mises au point par l\u2019Alliance mondiale de g\u00e9nomique et de sant\u00e9<\/strong><\/a> et donne aux chercheurs des outils pour trouver, visualiser et analyser des ensembles de donn\u00e9es dans le nuage. Le Nuage COVID est mis au point par un consortium de partenaires canadiens<\/strong><\/a> et financ\u00e9 par la Supergrappe des technologies num\u00e9riques du Canada<\/strong><\/a>.<\/p>\n

Jusqu\u2019\u00e0 maintenant, les laboratoires et les chercheurs de sant\u00e9 publique du Canada \u00e9taient limit\u00e9s lorsqu\u2019ils voulaient brosser un tableau de la pand\u00e9mie de COVID-19 parce qu\u2019ils devaient fournir des donn\u00e9es \u00e0 diverses banques de donn\u00e9es internationales et les consulter, notamment la Global Influenza Surveillance & Response System (GISAID)<\/strong><\/a>, la banque de donn\u00e9es mondiales la plus importante de s\u00e9quences du coronavirus. Aucune base de donn\u00e9es ne contenait \u00e0 elle seule toute l\u2019information n\u00e9cessaire pour \u00e9tablir une strat\u00e9gie exhaustive et pancanadienne de surveillance g\u00e9nomique et, jusqu\u2019\u00e0 aujourd\u2019hui, il existait de nombreux obstacles \u00e0 l\u2019\u00e9change des donn\u00e9es propres au contexte canadien.<\/p>\n

Le portail canadien est pr\u00eat \u00e0 recevoir les s\u00e9quences des g\u00e9nomes viraux et les m\u00e9tadonn\u00e9es des laboratoires et des chercheurs de partout au Canada au cours des prochains jours et des prochaines semaines. Le portail \u00e9voluera activement. \u00c0 mesure de l\u2019ajout de s\u00e9quences virales, l\u2019\u00e9quipe de M.\u00a0Bourque et des collaborateurs continueront de d\u00e9velopper de nouveaux outils pour consulter, analyser et interpr\u00e9ter les donn\u00e9es.<\/p>\n

Maintenant que le RCanG\u00e9CO entame sa deuxi\u00e8me ann\u00e9e et que l\u2019infrastructure des donn\u00e9es pour la surveillance g\u00e9nomique nationale est en place, le Canada est bien plac\u00e9 pour r\u00e9agir \u00e0 la pand\u00e9mie de COVID-19 et contribuer efficacement \u00e0 la r\u00e9ponse internationale aux variants pr\u00e9occupants, g\u00e9rer les pand\u00e9mies futures et mettre \u00e0 profit l\u2019\u00e9change des donn\u00e9es g\u00e9nomiques pour faire progresser les initiatives de m\u00e9decine de pr\u00e9cision.<\/p>\n

Citations<\/strong><\/p>\n

\u00ab\u2009Le portail des donn\u00e9es est une \u00e9tape importante de la mise en \u0153uvre de la Strat\u00e9gie canadienne de lutte contre les variants pr\u00e9occupants. Cette solution canadienne d\u2019\u00e9change rapide des donn\u00e9es et de recherches dans les donn\u00e9es g\u00e9n\u00e9tiques d\u00e9taill\u00e9es des virus donnera aux chercheurs canadiens l\u2019information indispensable dont ils ont besoin pour lutter contre la COVID-19 et les menaces futures des maladies infectieuses.\u2009\u00bb
\n\u2013 L\u2019honorable Patty Hajdu, ministre de la Sant\u00e9 <\/em><\/p>\n

\u00ab\u2009Le monde a encore beaucoup \u00e0 faire pour vaincre la COVID-19 et l\u2019\u00e9change rapide des donn\u00e9es est l\u2019une des armes les plus efficaces \u00e0 notre disposition. Gr\u00e2ce au lancement du portail des donn\u00e9es du projet VirusSeq, nous disposons maintenant d\u2019une plateforme pour toutes les s\u00e9quences canadiennes du SRAS-CoV-2 et les m\u00e9tadonn\u00e9es connexes. Cette solution scientifique ouverte, cr\u00e9\u00e9e au Canada, simplifiera l\u2019acc\u00e8s \u00e0 des ensembles nationaux de donn\u00e9es indispensables aux chercheurs et aux repr\u00e9sentants de la sant\u00e9 publique et elle leur permettra de collaborer. Au bout du compte, elle renforcera notre capacit\u00e9 de prendre toutes sortes de d\u00e9cisions et de faire toutes sortes de d\u00e9couvertes qui permettront au Canada de sortir de cette pand\u00e9mie et nous aideront \u00e0 g\u00e9rer la prochaine.\u2009\u00bb
\n\u2013<\/em> Guillaume Bourque, D\u00e9partement de g\u00e9n\u00e9tique humaine, Universit\u00e9 McGill, et directeur, Canadian Centre for Computational Genomics<\/em>.<\/p>\n

\u00ab\u2009La pand\u00e9mie de COVID-19 a accentu\u00e9 l\u2019importance des donn\u00e9es et de leur \u00e9change. Les virus ne connaissent pas de fronti\u00e8res et pour cette raison, la mise au point de strat\u00e9gies efficaces en sant\u00e9 publique n\u00e9cessite aussi un acc\u00e8s sans fronti\u00e8res aux donn\u00e9es. Le lancement du portail des donn\u00e9es du projet VirusSeq aujourd\u2019hui est une \u00e9tape importante et n\u00e9cessaire pour que le Canada continue d\u2019avancer. Le portail appuiera la Strat\u00e9gie canadienne de lutte contre les variants pr\u00e9occupants, approfondira la contribution du pays aux efforts nationaux et internationaux de surveillance g\u00e9nomique et \u00e0 la prise de d\u00e9cisions en sant\u00e9 publique.\u2009\u00bb
\n\u2014 Catalina Lopez-Correa, directrice ex\u00e9cutive, RCanG\u00e9CO <\/em><\/p>\n

\u00ab\u2009Maintenant plus que jamais, les d\u00e9cideurs doivent acc\u00e9der rapidement aux donn\u00e9es sur les variants pr\u00e9occupants. En lan\u00e7ant ce portail, nous fournissons l\u2019infrastructure qui facilitera la recherche collaborative et la d\u00e9couverte gr\u00e2ce \u00e0 l\u2019\u00e9change ouvert et \u00e0 l\u2019analyse des donn\u00e9es g\u00e9nomiques partout au pays. Nous sommes heureux d\u2019appuyer cet effort par l\u2019int\u00e9gration de la plateforme nuagique COVID qui permet de partager les donn\u00e9es canadiennes selon les normes de l\u2019industrie et de simplifier leur analyse dans le contexte des donn\u00e9es internationales. Le lancement du portail est une \u00e9tape importante dans le renforcement de notre d\u00e9fense contre la COVID-19 afin de prot\u00e9ger la sant\u00e9 et la s\u00e9curit\u00e9 des Canadiennes et des Canadiens.\u2009\u00bb
\n\u2014 Marc Fiume, PDG, DNAstack <\/em><\/p>\n

Faits rapides<\/strong><\/p>\n