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Assemblage rapide et accessible du génome, à l’aide du séquençage de lectures longues

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Résultat

Statut

Active

Concurrence

Concours 2015 en bio-informatique et en génématique

Centre(s) de génomique

GE3LS

No

Chef(s) de projet

Lancement du projet d'exercice financier

2016-2017

Description du projet

La technologie de séquençage de l’ADN a progressé, passant du séquençage de génomes de référence uniques, qui coûtait cher et nécessitait un temps considérable, à l’ère actuelle du séquençage avec lectures courtes peu coûteux et à haut rendement. La « troisième génération »  de la technologie de séquençage de l’ADN qui commence à émerger offre la possibilité de mettre le séquençage de lectures longues du génome aux mains d’un plus grand nombre de chercheurs, ce qui permettra de nouvelles applications, grâce aux instruments portables qui décentraliseront la technologie de séquençage.

M. Jared Simpson, Ph. D., de l’Université de Toronto, met au point un logiciel d’assemblage génomique solide et efficace, facile d’utilisation, pour faire correspondre les capacités de ces nouveaux instruments de séquençage. Le logiciel s’adressera aux biologistes et à d’autres utilisateurs finaux du séquençage qui ne possèdent pas beaucoup d’expertise en bio-informatique.

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