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Dockstore : une plateforme de partage des outils indépendants d’informatique en nuage avec la communauté des chercheurs

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Résultat

Statut

Actif

Concurrence

Concours 2015 en bio-informatique et en génématique

Centre(s) de génomique

GE3LS

Non

Chef(s) de projet

Lancement du projet d'exercice financier

2016-2017

Description du projet

Une conséquence inattendue de l’essor de la génomique a été la prolifération des grands ensembles de données, ce qui rend l’analyse de plus en plus difficile. Un autre problème est l’absence de normalisation dans la présentation, la description et l’exécution des outils d’analyse dans les différents environnements informatiques. Vincent Ferretti, Ph. D., et Lincoln Stein, Ph. D., de l’Institut ontarien de recherche sur le cancer, en collaboration avec Brian O’Connor, Ph. D., de l’Université de Californie, à Santa Cruz, ont mis au point une application Web appelée Dockstore qui vise à résoudre le problème d’encapsulation et de partage des outils de bio-informatique pour qu’ils puissent passer d’un environnement à un autre.

Les chercheurs ajoutent maintenant des caractéristiques importantes à la plateforme Dockstore pour continuer de l’améliorer et de la faire évoluer. Ils intégreront également les outils bio-informatiques et les flux de production de la Global Alliance for Genomics and Health (GA4GH) en vue de les redistribuer à la grande communauté des chercheurs et ils travailleront avec des collaborateurs pour faciliter l’enregistrement de leurs outils de haute qualité dans Dockstore. En dernier lieu, les chercheurs collaboreront avec d’autres projets pour faciliter le partage des outils entre des services d’archives génomiques. Ces activités stimuleront l’utilisation de Dockstore, ce qui accroîtra le partage des outils entre les chercheurs dans des domaines aussi diversifiés que l’agriculture, l’énergie et la santé humaine.

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