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MutaQuant : Un puissant outil de phénotypage protéogénomique pour la médecine de précision
Résultat
Statut
Concurrence
Centre(s) de génomique
GE3LS
Chef(s) de projet
- Christoph Borchers (Université McGill), René Zahedi (MRM Proteomics),
Lancement du projet d'exercice financier
Description du projet
En oncologie de précision, la méthode actuelle de dépistage de mutations génomiques spécifiques, même en utilisant la transcriptomique (l’ensemble complet de toutes les molécules d’ARN), ne permet de prédire que modérément le succès des thérapies ciblées contre le cancer. Au Canada, les tests génomiques d’oncologie de précision coûtent environ 40 millions de dollars par an et ont des taux de réponse d’environ 52 %. Commees protéines sont les principales cibles des médicaments, la génomique seule ne permet souvent pas de déterminer quelles mutations sont biologiquement pertinentes dans une tumeur donnée. Il est donc important de déterminer trois éléments clés : i) comment les mutations affectent les niveaux d’expression des protéines; ii) quelles mutations s’expriment réellement au niveau des protéines en quantités pertinentes plutôt que d’être simplement codées dans le génome; et iii) dans quelle mesure ces mutations sont exprimées dans un échantillon donné. Ce projet mettra au point des kits de spectrométrie de masse permettant de déchiffrer l’impact, au niveau des protéines, de quelque 1 000 mutations cancéreuses connues, qui représentent les principaux facteurs de cancer et les principales cibles des médicaments. MRM Proteomics et Agilent Technologies commercialiseront des trousses « MutaQuant » innovantes et validées, fourniront une formation sur leur utilisation et offriront un service d’analyse d’échantillons. Il est possible de réaliser d’importantes économies en prévenant les traitements inefficaces du cancer et en améliorant les résultats pour les patients.