Résultat

Cohorte : Cohortes de maladies dans toutes les Prairies

Ce projet de séquençage facilitera la découverte du bagage génétique des populations du Manitoba et de la Saskatchewan, afin d’améliorer l’efficacité des soins de santé, de réduire les coûts et d’améliorer les résultats des patients dans les Prairies. 

Résumé : PrairieGen fera ressortir la diversité génétique du Manitoba et de la Saskatchewan, en identifiant des biomarqueurs essentiels, des variants génétiques et des facteurs de risque émergents dans ces populations. PrairieGen s’appuie sur des initiatives en cours, comme les plateformes multi-omiques du projet d’intégration de la génomique au Manitoba (Mainstreaming Genomics in Manitoba; MGM), les cohortes de sclérose en plaques du Manitoba et de la Saskatchewan, la cohorte de schizophrénie du Manitoba, le Manitoba Tomorrow Project (MTP), la Manitoba Tumor Bank (MTB), le Manitoba Taste and Oral Microbiome Project, la cohorte Manitoba Imagine (MICI), la cohorte de l’étude CHILD du Manitoba, la cohorte iCARE du Manitoba, la cohorte des patients atteints de troubles métaboliques en Saskatchewan et d’autres cohortes mixtes. Ces sources de données omiques seront unifiées. En appliquant des analyses globales avancées de la génomique, ce projet produira des renseignements ayant des applications cliniques afin d’orienter les investissements publics et d’améliorer les décisions politiques en matière de santé au Manitoba, en Saskatchewan et au Canada. Ce projet s’appuie sur les pipelines existants de séquençage et d’analyse multi-omiques aux principales installations d’Action cancer Manitoba et de la Rady Faculty of Health Sciences (RFHS) et intégrera les données de séquençage du génome entier (SGE) à lecture courte générées au centre national de séquençage, avec séquençage local du génome entier à lecture longue basé sur les nanopores et les génomes humains de télomère à télomère, les méthylomes d’ADN au moyen d’un séquençage direct de l’ADN, les profils transcriptomiques/épitranscriptomiques au moyen du séquençage direct de l’ARN et d’autres données omiques du MGM. Toutes les données omiques générées, l’épigénomique/la génomique, l’épitranscriptomique/la transcriptomique, ainsi que la protéomique et la métabolomique, seront intégrées à des données cliniques pour produire une base de données centralisée afin de brosser un tableau génomique multiniveau de chaque participant consentant à partir des données agrégées communiquées régulièrement aux chefs des cohortes et aux commanditaires de l’étude. PrairieGen améliorera la configuration actuelle du MGM et mettra en œuvre un cadre normalisé pour le consentement des participants et la gestion et la protection des données. Ce cadre assure le traitement sécurisé des données pour tous les participants et facilite la simplification des initiatives de génomique en cours au Manitoba et en Saskatchewan. En intégrant les données omiques existantes des cohortes susmentionnées aux nouvelles données multi-omiques générées, PrairieGen cherche à créer la base de données génomiques, multi-omiques et sur la santé de précision la plus grande et la plus complète, générée et gérée au Manitoba et en Saskatchewan et adaptée aux caractéristiques particulières des populations de ces provinces. Au moyen de ces technologies, ce projet permettra de créer un environnement favorable et donnera confiance aux cliniciens et aux décideurs pour améliorer l’efficience des soins de santé, réduire les coûts et améliorer les résultats des patients en permettant des interventions de précision adaptées aux régions et mises en œuvre à l’échelle régionale. PrairieGen renforce la capacité de recherche régionale en améliorant continuellement les plateformes et pipelines bio-informatiques à Action cancer Manitoba et à la RFHS et renforce l’inclusion du Manitoba et de la Saskatchewan dans l’innovation de la santé de précision, en vue d’améliorer considérablement la santé de la population dans ces deux provinces.