Résultat

Cohorte : Patients pédiatriques 

Ce projet de séquençage permettra un diagnostic et un traitement plus précoces et plus efficaces des maladies infantiles, ce qui éclairera la prise en charge préventive en vue de réduire les complications et d’améliorer les taux de survie et la qualité de vie. 

Résumé : Les maladies infantiles sont très pénétrantes, héréditaires et souvent polygéniques. Elles ont des répercussions qui durent toute la vie, en particulier à mesure que des avancées en médecine améliorent la survie jusqu’à l’âge adulte. Ces maladies entraînent un lourd fardeau sur les patients, les familles et les ressources en soins de santé pendant toute la vie des patients. Un diagnostic précoce est essentiel pour éclairer la prise en charge préventive en vue de réduire les complications et d’améliorer les taux de survie et la qualité de vie. Le rendement des tests génétiques conventionnels est sous-optimal pour les maladies génétiquement hétérogènes. Le séquençage du génome entier (SGE) offre une caractérisation génétique complète en examinant les altérations rares et fréquentes non seulement au niveau des régions de codage des protéines, mais aussi des variants dans la « matière noire » du génome, des variants structurels complexes, des expansions répétitives en tandem et des variants réglementaires dans le génome hors code. L’objectif du projet Santé de précision pour les enfants – séquençage complet pour les maladies infantiles chroniques (PCHSeq) est de tirer parti de la puissance de la génomique afin de permettre un diagnostic plus précoce et plus précis et de prédire l’évolution de la santé et d’établir des objectifs thérapeutiques innovants pour orienter les soins personnalisés et améliorer les résultats. Ces efforts reposent sur la génération de séquençage génomique à lecture courte sur des échantillons d’ADN de 9 500 participants (y compris les membres de leur famille), avec une diversité de maladies se déclarant pendant l’enfance, et un séquençage à lecture longue dans un sous-ensemble de 800 patients dont le génotype est insaisissable. Grâce à son accès à une population très diversifiée de patients atteints de maladies rares et complexes et sous la direction de SickKids de l’Ontario et d’ailleurs au pays, l’équipe de PCHSeq a déjà inscrit 9 296 participants potentiellement admissibles atteints de maladies se déclarant pendant l’enfance dans les biobanques existantes. Les cohortes sont cliniquement et géographiquement diversifiées, la composition en fonction du genre et de l’origine ethnique reflétant celle de l’ensemble de la population du Canada. En plus de ces participants admissibles existants, 3 500 nouveaux participants seront recrutés au moyen d’une approche ciblée pour inviter les patients de communautés mal desservies à participer. Dans l’ensemble, cette étude fournira un ensemble de données génomiques riche apparié à des phénotypes cliniques et à d’autres ensembles de données moléculaires/omiques qui sont représentatifs de la diversité ethnique et clinique de la population canadienne dans un éventail de maladies apparaissant pendant l’enfance et ayant des répercussions pendant toute la vie. Des conséquences cliniques immédiates se manifesteront par les constatations ayant une application médicale pour les médecins et les participants après un examen par le conseil génomique de SickKids. Une évaluation des technologies liées à la santé sera effectuée afin d’évaluer les perspectives des patients et de la communauté à l’égard de l’utilisation du séquençage génomique comme test diagnostique clinique. Les collaborations avec l’industrie seront axées sur l’élaboration de thérapies ciblées. Notre équipe a une réputation de longue date dans le domaine de la recherche en santé de précision pour générer un grand nombre des ensembles de données publics sur le séquençage génomique, les premiers et les plus vastes en leur genre. Nous croyons également que l’investissement dans le séquençage génomique de cohortes pédiatriques et leur famille est essentiellement stratégique, parce que ces cohortes englobent des maladies génétiques rares et courantes, et que les données seront utiles tout au long de la vie des patients.