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Séquençage du génome entier et profilage du transcriptome en réponse à la vaccination des poissons nettoyeurs Cyclopterus Lumpus et Tautogolabrus Adsperus

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Résultat

Statut

Active

Concurrence

Programme de partenariats pour les priorités régionales (P3R)

Centre(s) de génomique

GE3LS

No

Chef(s) de projet

Lancement du projet d'exercice financier

2019-2020

Description du projet

Au cours des dix dernières années, l’industrie de l’aquaculture dans la province de Terre-Neuve-et-Labrador (T.-N.-L.) a connu une croissance importante (jusqu’à 1 500 %). Cependant, l’un des principaux défis sanitaires de cette industrie est le pou du poisson, lequel limite la croissance de l’industrie et compromet la durabilité. Les infestations de poux sont l’un des plus gros problèmes de l’élevage du saumon aujourd’hui, coûtant aux producteurs jusqu’à 150 dollars canadiens par tonne produite chaque année en pertes et traitements. En 2017, la Newfoundland Aquaculture Industry Association (NAIA), par le biais de consultations avec l’industrie, a indiqué que les stratégies de lutte intégrée contre le pou du poisson étaient la grande priorité de l’industrie pour le secteur de la salmoniculture à T.-N.-L. Une stratégie efficace de lutte contre les poux de mer fait intervenir des poissons nettoyeurs, c’est-à-dire des lompes (Cyclopterus lumpus) et des tanches-tautogues (Tautogolabrus adsperus). L’utilisation de poissons nettoyeurs a été jugée hautement prioritaire par toutes les entreprises de pêche au saumon de T.-N.-L. : Cooke Aquaculture Inc, Northern Harvest Seafarms Limited, Grieg N.L. et Marine Harvest Atlantic Canada. L’utilisation de poissons nettoyeurs est intéressante parce qu’ils réduisent l’utilisation de produits chimiothérapeutiques et sont moins stressants pour les poissons. Le nombre de poissons nettoyeurs utilisés par l’industrie mondiale de la salmoniculture a augmenté de manière exponentielle depuis 2008. On estime qu’il faudra 50 millions de poissons nettoyeurs d’ici 2020. La production commerciale de poissons nettoyeurs est une industrie émergente qui a le potentiel de générer de nombreux nouveaux emplois. Le centre d’études océaniques Ocean Sciences Centre du Memorial University est le premier centre de recherche et développement de poisson nettoyer en Amérique du Nord.&D facility. However, industrial production faces challenges due to the lack of knowledge about the biology of these fish species, limiting the rapid growth of this emerging industry. Susceptibility of lumpfish and cunner to bacterial infectious diseases, lack of a vaccination program, and lack of broodstock production programs, are the major challenges facing cleaner fish production for use in aquaculture biocontrol. C. lumpus and T. adspersus are on the list of the 100 fish gold standard genomes to be sequenced, and the sequence of these fish will contribute to fundamental biodiversity knowledge, and fill a critical gap in fundamental knowledge that will allow the development of specific vaccination programs and accelerate commercial production of an emergent aquaculture sector. In this proposed research, we will sequence the whole genome of C. lumpus and T. adspersus and profile the global gene expression response to vaccination and bacterial infection. The specific objectives are to: i) sequence the genomes of C. lumpus and T. adspersus; Recherche et développement ii) mettre au point un modèle d’infection bactérienne par cohabitation et établir le profil de l’expression génétique de C. lumpus et T. adspersus infectés et iii) établir le profil de l’expression génétique de C. lumpus et T. adspersus vaccinés et évaluer l’efficacité du vaccin commercial et amélioré (en interne). Nous espérons générer les connaissances essentielles qui permettront d’accélérer la croissance de l’industrie du poisson nettoyeur commercial au Canada et de contribuer au développement des programmes de vaccination et d’élevage.

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